Descubren un nuevo antibiótico con una técnica novedosa

Investigadores de Países Bajos y Reino Unido han descubierto un nuevo antibiótico mediante el empleo de una novedosa herramienta para "excavar" en genomas bacterianos.

La investigación, publicada en la revista Microbiology, podría ser un gran refuerzo en la lucha contra los virus resistentes a múltiples fármacos.

Se trata del primer estudio que ha aplicado la técnica de extracción genómica (genome mining) a una bacteria común denominada Streptomyces.

Estos resultados son fruto del proyecto ACTINOGEN (Integrar aplicaciones basadas en genómica para aprovechar actinobacterias como recurso para nuevos antibióticos), al que se adjudicó una financiación de cerca de 9,4 millones de euros por medio del área temática "Ciencias de la vida, genómica y biotecnología aplicadas a la salud", con la misión de acelerar el proceso de descubrimiento de medicamentos y sacar provecho de fuentes infraexplotadas de más antibióticos que superen a los actuales.

El Streptomyces es un género de actinobacteria que se localiza en el suelo junto con el compost, que se emplean para producir la mayoría de los antibióticos de origen natural actualmente en venta.

En 2002, la secuenciación del genoma de la especie Streptomyces coelicolor sacó a relucir doce grupos de genes "huérfanos" cuya función se desconoció en ese entonces y que hasta el día de hoy no se usaron para crear antibióticos. Los genes fueron objetivo de numerosas investigaciones.

En el estudio reciente,  expertos de la Universidad de Groninga (Países Bajos) y el Centro John Innes (Reino Unido) examinaron los productos de un grupo de genes huérfanos, denominados cpk, a través de la técnica de la "extracción genómica".

Los científicos eliminaron una parte de dicho grupo, llamada scbR2, para desactivar la totalidad del grupo cpk. De este modo, evaluaron la influencia de scbR2 en el metabolismo de S. coelicolor.

Al manipular un gen regulador, lograron activar a los genes "silenciosos".

Este experimento sacó a relucir un nuevo metabolito (el yCPK de pigmentación amarilla) así como una nueva sustancia antibiótica llamada abCPK.

Se ha observado que el nuevo compuesto antibacteriano es eficaz contra diversas cepas bacterianas, entre ellas Escherichia coli. (vive en el intestino y es causa emergente de enfermedad transmitida por los alimentos; este germen provoca cólicos severos y diarrea).

"Se trata de una estrategia eficaz e innovadora para buscar nuevas fuentes de producción de antibióticos en bacterias", aseguró el Dr. Eriko Takano de la Universidad de Groninga. "Infecciones bacterianas que antes se consideraban leves y fáciles de curar de repente están resultando letales e inmunes completamente a todos los medicamentos existentes, por lo cual es indispensable seguir encontrando  antibióticos con rapidez."

A partir de esta experiencia se podría establecer una técnica importante para el descubrimiento de antibióticos,  u otros compuestos de utilidad, que en la actualidad se encuentran "ocultos" en los genomas de organismos secundarios, productores de metabolitos como los hongos filamentosos.

"Hay varios miles más de grupos de genes sin caracterizar que se acaban de hallar en secuencias de genomas microbianos", indicó. Takano. "Se ha descubierto un "gran tesoro" con la posibilidad de ofrecer nuevos fármacos de utilidad clínica."